Смею сказать, что безумцы и уродцы у Таргов начали рождаться, напротив, из-за близкородственного скрещивания. Переход рецессивных мутаций в гетерозиготное состояние. И вот периодичнское вливание посторонней крови - выход, если оно не частое. И точно необходимо большое количество родственников- Таргариенов, чтобы инбридинг между ними было хотябы IV к IV. Иначе точно вымрут
Далее , с точки зрения генетики, мы получаем одинаковое число генов от матери и от отца. Т.е. здесь всё равно- по матери Тарг, или по отцу. А если говорить не о генетике, а о социальном факторе, то вопрос в том, кто воспитанием детей занимается. Рейниру воспитывал отец, таскал с собой на собрания и прочие государственные дела. Дядя ещё свой вклад внёс. Сыновей Алиссенты воспитывала мать. Отец не в состоянии уже был. Т.е, скажем , ментально Рейнира больше Тарг, чем Эйгон.
И по поводу внешности детей Рейниры. Видимо, она дала им гены дедушки- Аррена, в сочетании с генами тёмного Стронга дали тёмных детей. Т.е. она была гетерозиготна , потому половина её потомства от темного гомозиготного мужчины будет тёмной. Ну, тут трижды так выстрелило. И так бывает