В целом, консолидация и укрепление центральной власти более прогрессивный этап, чем феодальная раздробленность. Однако для такой централизации необходима скрепляющая идея. Лучшей скрепляющей идеей во все времена было "совместное противостояние общему врагу". Так сформировались все империи в истории.
Однако я не очень понимаю, кто был назначен общим врагом народов Вестеросса? Жители Эссоса? Ну, их военный потенциал невелик, с момента прихода ройнаров, которые кроме пустынного Дорна ничего не смогли захватить, экспансий на восток из Эссоса не было. В таком качестве могли выступать Белые Ходоки, но к моменту завоевания Таргариенами в Белых Ходоков никто уже не верил, а сами "повелители драконов" о них вообще, наверное, ничего не слыхали.
Так что такую империю можно было объединять только силой. Других внешних причин для этого не было. А в таких ситуациях империя долго ( в историческом смысле ) не живет.
На смену империи приходит федерация по образцу британского содружества. Централизация власти ослабевает, власть монарха становится номинальной и ритуально-представительской, а бразды правления переходят к экономической элите и к дворянству. В какой-то момент происходит их слияние и мы получаем экономическое дворянство. А потом кланы внутри элиты начинают свою грызню, империя распадается, и все возвращается к моменту до завоевания Эйгона I - на свое место
Так что какие-то положительные аспекты у этого завоевания были, но в отсутствие скрепляющего королевства фактора долго эта империя просуществовать не могла. Что мы и наблюдали в сериале